Bioconductor
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AboutBioconductor The mission of the Bioconductor project is to develop, support, and disseminate free open source software that facilitates rigorous and reproducible analysis of data from current and emerging biological assays. We are dedicated to buildin
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Bioconductor provides tools for the analysis and comprehension of high-throughput genomic data. Bioconductor uses the R statistical programming language and is open source and open development.
바이오컨덕터(Bio conductor)는 여러 가지 게놈(Genome)데이터를 해석 할 수 있는 R 패키지로써 오픈 소스의 통계해석 소프트웨어(R)이다
– 바이오컨덕터는 마이크로 어레이(Micro array), DNA/아미노산 배열, 문헌정보 등 게놈데이터를 대상으로 한 패키지를 제공하고 있으며, 샘플데이터나 메타(Meta)데이터도 제공해서 바로 학습 및 해석에 이 용할 수 있다
○ 바이오컨덕터의 설치
– 바이오컨덕터는 R의 패키지가 탑재되어 R이 동작하는 환경에서 작동되 므로, 바이오컨덕터프로젝트가 제공하는 R 설치프로그램을 이용한다.
– 먼저 R을 가동시켜서, 프롬포트의 최초 항에 소스함수를 이용하여 바이오컨덕터 프로그램을 R로 읽어 들이면, 이 프로그램에 바이오 컨덕터의 설치기인 "biocLite" 함수가 정의되어 있어서 두 번째 항에 서 biocLite가 실행된다. 이 설치기에 의해 바이오컨덕터의 사이트에 서 기본패키지가 다운로드 되어 자동적으로 설치된다.
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